Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ssxb3Q6XAS4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms