Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ssx9Q6XAS3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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