Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
GcsamQ6RFH4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms