Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SvoplQ6PDF3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms