Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp49Q6P9L4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Usp49Q6P9L4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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