Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
BC061212Q6P8K3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms