Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Krt40Q6IFX3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt40Q6IFX3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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