Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scaf8Q6DID3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms