Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rftn1Q6A0D4 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.1 ms