Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Msl2Q69ZF8 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Msl2Q69ZF8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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Msl2Q69ZF8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
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Msl2Q69ZF8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Msl2Q69ZF8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms