Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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PtprdQ64487 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprdQ64487 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprdQ64487 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprdQ64487 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprdQ64487 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprdQ64487 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprdQ64487 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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PtprdQ64487 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PtprdQ64487 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
PtprdQ64487 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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PtprdQ64487 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprdQ64487 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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