Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms