Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Polr2kQ63871 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms