Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms