Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SnrpcQ62241 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms