Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms