Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pde3bQ61409 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pde3bQ61409 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms