Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Abcd2Q61285 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Abcd2Q61285 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Abcd2Q61285 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
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Abcd2Q61285 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Abcd2Q61285 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms