Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mre11Q61216 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mre11Q61216 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mre11Q61216 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mre11Q61216 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mre11Q61216 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mre11Q61216 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mre11Q61216 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mre11Q61216 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mre11Q61216 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mre11Q61216 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mre11Q61216 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms