Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rbbp4Q60972 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms