Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot7Q60809 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot7Q60809 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms