Protein–RNA interactions for Protein: Q60790

Rasa3, Ras GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasa3Q60790 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rasa3Q60790 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms