Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms