Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trim38Q5SZ99 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Trim38Q5SZ99 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Trim38Q5SZ99 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Trim38Q5SZ99 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Trim38Q5SZ99 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Trim38Q5SZ99 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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