Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Psme4Q5SSW2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms