Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp18Q5SSI6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms