Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc85aQ5SP85 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc85aQ5SP85 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Ccdc85aQ5SP85 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ccdc85aQ5SP85 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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