Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Shank3Q4ACU6 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Shank3Q4ACU6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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