Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Fam220aQ3ZN08 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms