Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc27Q3V036 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms