Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnpc3Q3UZ01 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms