Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SbsponQ3UPR9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SbsponQ3UPR9 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms