Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms