Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Skap2Q3UND0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Skap2Q3UND0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms