Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms