Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ctsll3Q3ULP7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms