Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sf3b2Q3UJB0 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms