Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ssbp4Q3U4B1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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