Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms