Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trappc9Q3U0M1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms