Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tbc1d2bQ3U0J8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tbc1d2bQ3U0J8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tbc1d2bQ3U0J8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tbc1d2bQ3U0J8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tbc1d2bQ3U0J8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Tbc1d2bQ3U0J8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tbc1d2bQ3U0J8 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Tbc1d2bQ3U0J8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Tbc1d2bQ3U0J8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tbc1d2bQ3U0J8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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