Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Shcbp1lQ3TTP0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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