Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zbtb38Q3LR78 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms