Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cpne9Q1RLL3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cpne9Q1RLL3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms