Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Trim71Q1PSW8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Trim71Q1PSW8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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