Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cers3Q1A3B0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms