Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ptchd1Q14B62 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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ptchd1Q14B62 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
ptchd1Q14B62 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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