Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Rpusd2Q149F1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rpusd2Q149F1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms