Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Atp2b3Q0VF55 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Atp2b3Q0VF55 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms