Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TrioQ0KL02 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TrioQ0KL02 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms